Mám stejný problém na MacBook Pro. Pozoruji jej nekolik poslednich verzi Captain. Nepomáhá ani BETA testing program.
Většinou v Safari, ale i v Excelu a dalších aplikacích (Safari běží na pozadí). Několik sekund nereaguje, často se objevuje "duhové kolečko" při tak jednoduchých opercích jako je pohyb ve stránce (Safari) apod., potom se automaticky rozběhne.